Этот отдел Министерства отвечает за различные вопросы, связанные с магическим транспортом.

Отдел магического транспорта включает в себя следующие подразделения:

Руководящий центр Сети летучего пороха: Подразделение отвечает за установку и поддержание Сети каминов, а также за распространение летучего пороха. Сеть летучего пороха состоит из каминов, находящихся во всех волшебных домах, связанных между собой. Сеть позволяет перемещаться из одного камина в другой благодаря магическим свойствам летучего пороха.
Сектор контроля за мётлами
Портальное управление
Трансгрессионый испытательный центр: Является магическим аналогом Агентства по лицензированию водителей и транспортных средств Соединённого Королевства. В этом центре выдаются лицензии волшебникам и колдуньям на право трансгрессии.

До сих пор остаётся неизвестным, управляет ли данный Отдел работой автобуса «Ночной Рыцарь».